Plateformes

L’institut est conforté par la présence de différentes plateformes d’envergure au sein des établissements de santé partenaires :

Les plateformes de génétique du CHU de Dijon et du CGFL pour les maladies rares et l’oncologie, et le plateau technique du CHU de Besançon. Elles assurent ensemble la prise en charge diagnostique des cancers, des hémopathies malignes et des maladies rares et le développement de techniques innovantes.
La plateforme de transfert en biologie cancérologique du CGFL avec, pour la partie génétique des tumeurs, la plateforme pilotée par le Dr Romain Boidot. Cette plateforme réalise le séquençage haut débit d’exome des tumeurs et de l’ADN constitutionnel.
La plateforme d’analyse bioinformatique dédiée au management et à l’analyse des données de séquençage basées sur le séquençage haut débit pangénomique, coordonnée par M. Yannis Duffourd. La plateforme BIOME analyse en routine les données de séquençage haut débit d’exome et a développé son propre pipeline bioinfomatique et les outils nécessaires à l’analyse de séquençage haut débit de génome, aussi bien pour l’identification de variants de structure, de SNV que de CNV.
Les plateformes de biotechnologies et de recherche clinique précoce du CIC-BT1431 et du CGFL. Ces plateformes réunissent les expertises des immunologistes, des bio-statisticiens et des oncologues du site pour développer des biomarqueurs immunologiques et promouvoir de nouvelles stratégies thérapeutiques immunologiques.

Laboratoire de diagnostic	Plateformes	Responsable	Référent pour l'activité (si différent du responsable)
Laboratoire de Cytogénétique et Génétique moléculaire	CHU Dijon	Pr. P. Callier	Dr C. Philippe : maladies rares Dr. M. Callanan : oncogénétique
Laboratoire de Cytogénétique et Génétique moléculaire	CHU Besançon	-	Dr P. Kuentz
Laboratoire d'Anatomie-Pathologie	CGFL	Dr L. Arnould	-
Laboratoire d'Anatomie-Pathologie	CHU Besançon	Pr S. Degano-Valmary	-
Laboratoire d'Anatomie-Pathologie	CHU Dijon	Pr L. Martin	Dr C. Chapusot Dr Tournier
Laboratoire d'Hématologie	CHU Dijon	Pr M. Maynadié	Dr. F. Girodon
Plateforme INCa	CHU Dijon/CGFL	Pr L. Martin	Dr R. Boidot Dr C. Chapusot
Plateforme INCa	CHU Besançon	Pr JL. Prétet	Dr D. Guenat Dr S. Magnin
Centre de ressources biologiques Ferdinand Cabanne	-	Pr A. Bonin	Dr S. Bechoua

D’autres plateformes supports sont des partenaires privilégiés :

le CCuB (Centre de Calcul et datacenter de l’Université de Bourgogne)
le Centre de Ressources Biologiques Ferdinand Cabanne
différentes autres plateformes technologiques (biosurveillance, ingénierie cutanée, protéomiques, lipidomiques, cellulaires, investigations technologiques …) également présentes sur les sites de Dijon et de Besançon.